16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1619 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1619  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  219  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0429  hypothetical protein  81.9 
 
 		 116 aa  147  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.697618  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3430  hypothetical protein  58.18 
 
 		 119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.692072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1178  hypothetical protein  61.4 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1250  hypothetical protein  56.14 
 
 		 119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4185  hypothetical protein  56.52 
 
 		 123 aa  117  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.295357  normal  0.923646 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2359  hypothetical protein  56.64 
 
 		 118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686199  unclonable  0.000000113838 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1392  hypothetical protein  53.45 
 
 		 123 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2865  hypothetical protein  47.62 
 
 		 114 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0689  hypothetical protein  47.37 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.293413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2180  hypothetical protein  47.79 
 
 		 117 aa  93.6  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2400  hypothetical protein  47.79 
 
 		 117 aa  93.6  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0942  hypothetical protein  46.9 
 
 		 117 aa  83.6  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0487  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36370  hypothetical protein  38.14 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.375458  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1427  hypothetical protein  34.44 
 
 		 124 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.273174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>