31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3471 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3471  TfuA domain-containing protein  100 
 
 		 451 aa  872    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6311  TfuA domain protein core  42.01 
 
 		 464 aa  263  6e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3204  TfuA domain protein core  47.83 
 
 		 235 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.909027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4529  TfuA domain-containing protein  48.06 
 
 		 234 aa  176  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.357658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2956  TfuA domain protein core  47.34 
 
 		 235 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0526  TfuA-like, core  45.63 
 
 		 213 aa  163  8.000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1332  TfuA domain-containing protein  47.62 
 
 		 217 aa  160  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0861  TfuA-like protein  49.21 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.060609  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7196  TfuA domain protein core  41.38 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.0994766 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2262  TfuA-like  43.36 
 
 		 238 aa  152  8.999999999999999e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6038  TfuA domain protein core  40.34 
 
 		 247 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.345548  normal  0.623723 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0590  hypothetical protein  39.62 
 
 		 213 aa  149  7e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0804976  hitchhiker  0.00134813 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1210  TfuA domain protein core  41.35 
 
 		 208 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0918  TfuA domain-containing protein  47.39 
 
 		 411 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.124979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1977  TfuA domain-containing protein  42.65 
 
 		 216 aa  145  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0265574  normal  0.793064 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0014  hypothetical protein  30.75 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.175575  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11405  hypothetical protein  35.21 
 
 		 497 aa  136  9e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000176066  normal  0.617932 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6107  TfuA domain-containing protein  38.57 
 
 		 456 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.620154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1989  TfuA domain-containing protein  43.4 
 
 		 258 aa  133  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2070  TfuA-like protein  38.39 
 
 		 214 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0010  hypothetical protein  29.75 
 
 		 344 aa  133  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0910  TfuA domain protein core  48.04 
 
 		 403 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000252164  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0906  TfuA domain protein core  48.68 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.976855  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1402  TfuA domain-containing protein  41.75 
 
 		 208 aa  127  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0428  TfuA domain-containing protein  30.56 
 
 		 218 aa  117  6e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1564  TfuA domain-containing protein  34.21 
 
 		 214 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0481  TfuA domain-containing protein  34.74 
 
 		 214 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0355  TfuA domain-containing protein  33.16 
 
 		 214 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00180468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0822  hypothetical protein  32.38 
 
 		 219 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1703  hypothetical protein  36.65 
 
 		 882 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0101  hypothetical protein  36.73 
 
 		 133 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0459424  normal  0.621071 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>