16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2764 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2764  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  336  8e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2499  hypothetical protein  56.1 
 
 
178 aa  179  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0623161  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3134  hypothetical protein  69.57 
 
 
184 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.408769  hitchhiker  0.0000561841 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0412  hypothetical protein  48.02 
 
 
160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0044  hypothetical protein  66.37 
 
 
156 aa  155  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000485186 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0841  hypothetical protein  50.32 
 
 
208 aa  148  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.162645  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0046  hypothetical protein  65.22 
 
 
162 aa  130  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.185618 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1281  hypothetical protein  42.57 
 
 
188 aa  79  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.864029 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3632  hypothetical protein  42.45 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5031  hypothetical protein  33.72 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.336697 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2956  hypothetical protein  39.13 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2051  hypothetical protein  45 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.547362  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3021  hypothetical protein  42.57 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3214  hypothetical protein  41.58 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2853  hypothetical protein  32.75 
 
 
197 aa  62.4  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.140453  normal  0.0482245 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0636  hypothetical protein  38.78 
 
 
175 aa  61.2  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.248742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>