46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2214 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2214  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  167  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.309689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0621  hypothetical protein  73.75 
 
 		 87 aa  118  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1581  hypothetical protein  68.75 
 
 		 82 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00359975  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0233  hypothetical protein  68.75 
 
 		 82 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3332  hypothetical protein  68.35 
 
 		 79 aa  110  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296234  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2648  hypothetical protein  67.5 
 
 		 80 aa  110  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0261  hypothetical protein  68.29 
 
 		 82 aa  110  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.783765 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3020  protein of unknown function DUF526  59.04 
 
 		 86 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2757  protein of unknown function DUF526  57.83 
 
 		 86 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3170  hypothetical protein  51.9 
 
 		 91 aa  84.3  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2263  hypothetical protein  55.41 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1640  hypothetical protein  52.5 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2251  hypothetical protein  52.5 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.801472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1476  hypothetical protein  52.5 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0240368  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1526  hypothetical protein  52.5 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3536  hypothetical protein  54.43 
 
 		 91 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.764838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1136  protein of unknown function DUF526  55.56 
 
 		 88 aa  79.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059241 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2149  hypothetical protein  49.35 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1766  hypothetical protein  51.32 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0993  hypothetical protein  45.95 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0435364  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2505  hypothetical protein  46.91 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4065  protein of unknown function DUF526  43.04 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4026  protein of unknown function DUF526  43.04 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.180444  normal  0.460906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3771  hypothetical protein  43.04 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4162  hypothetical protein  47.37 
 
 		 92 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.186646 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0853  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3873  hypothetical protein  46.05 
 
 		 92 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0389052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1414  hypothetical protein  44.74 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0680005  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3096  hypothetical protein  46.05 
 
 		 85 aa  67  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1375  protein of unknown function DUF526  42.31 
 
 		 96 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308026  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4948  hypothetical protein  40.26 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.889907  hitchhiker  0.000000138953 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0762  hypothetical protein  45.68 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.468252 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4841  protein of unknown function DUF526  44.74 
 
 		 92 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4470  hypothetical protein  48.68 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2547  hypothetical protein  44.44 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0040  hypothetical protein  47.44 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.479768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0675  hypothetical protein  42.86 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1095  protein of unknown function DUF526  34.57 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2667  hypothetical protein  39.53 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149229  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0427  hypothetical protein  40.26 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0520  hypothetical protein  37.84 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166943  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0459  hypothetical protein  37.84 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0462985  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2138  hypothetical protein  34.25 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0191  hypothetical protein  34.94 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0069  hypothetical protein  34.67 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0215  hypothetical protein  34.94 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.739571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>