13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0496 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0496  Hpt protein  100 
 
 		 116 aa  228  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2886  Hpt protein  51.46 
 
 		 118 aa  107  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2648  Hpt protein  48.91 
 
 		 116 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6148  histidine phosphotransfer domain-containing protein  46.74 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00449126  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3484  Hpt domain protein  41 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0070  Hpt domain-containing protein  32.98 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2871  Hpt protein  50 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 738 aa  44.3  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 		 873 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  32.76 
 
 		 727 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3450  hypothetical protein  36.25 
 
 		 118 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 876 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34350  histidine-containing phosphotransfer protein  34.09 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.223554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>