298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_R0048 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



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Replicon accession

Locus tag

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% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_R0023  5S ribosomal RNA  100 
 
 
114 bp  226  9e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.7425 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0048  5S ribosomal RNA  100 
 
 
114 bp  226  9e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.926696  normal  0.0497776 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0055  5S ribosomal RNA  99.12 
 
 
118 bp  218  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433346  hitchhiker  0.00000502175 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0065  5S ribosomal RNA  99.12 
 
 
118 bp  218  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028653  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0070  5S ribosomal RNA  99.12 
 
 
118 bp  218  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282542  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0060  5S ribosomal RNA  99.12 
 
 
118 bp  218  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.873791  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0056  5S ribosomal RNA  99.12 
 
 
114 bp  218  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0061  5S ribosomal RNA  99.12 
 
 
114 bp  218  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0159471  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0018  5S ribosomal RNA  99.12 
 
 
118 bp  218  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0046  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 
114 bp  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00731319 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0054  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 
114 bp  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0163881  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0059  5S ribosomal RNA  97.37 
 
 
114 bp  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.756267 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0022  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 
102 bp  178  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0034  5S ribosomal RNA  92 
 
 
115 bp  101  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000354404  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0041  5S ribosomal RNA  92 
 
 
115 bp  101  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0049  5S ribosomal RNA  92 
 
 
115 bp  101  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.119375  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0020  5S ribosomal RNA  89.36 
 
 
115 bp  99.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.8682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0055  5S ribosomal RNA  89.36 
 
 
115 bp  99.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.533028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0010  5S ribosomal RNA  89.36 
 
 
115 bp  99.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4842  5S ribosomal RNA  88.3 
 
 
120 bp  93.7  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5399  5S ribosomal RNA  88.3 
 
 
120 bp  93.7  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0966302  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0815  5S ribosomal RNA  88.3 
 
 
120 bp  93.7  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6149  5S ribosomal RNA  88.3 
 
 
120 bp  93.7  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.989968  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08610  5S ribosomal RNA  88.3 
 
 
132 bp  93.7  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402546 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55620  5S ribosomal RNA  88.3 
 
 
132 bp  93.7  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.431806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62050  5S ribosomal RNA  88.3 
 
 
132 bp  93.7  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70870  5S ribosomal RNA  88.3 
 
 
132 bp  93.7  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0015  5S ribosomal RNA  86.54 
 
 
120 bp  89.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.832778  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0003  5S ribosomal RNA  86.54 
 
 
121 bp  89.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.685817  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0007  5S ribosomal RNA  86.54 
 
 
121 bp  89.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0064  5S ribosomal RNA  86.54 
 
 
121 bp  89.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.648247  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0111  5S ribosomal RNA  86.54 
 
 
121 bp  89.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0121  5S ribosomal RNA  86.54 
 
 
120 bp  89.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.667113  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0128  5S ribosomal RNA  86.54 
 
 
121 bp  89.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0013  5S ribosomal RNA  86.54 
 
 
121 bp  89.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.84229  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0038  5S ribosomal RNA  85.59 
 
 
120 bp  87.7  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.988118  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r03  5S ribosomal RNA  85.59 
 
 
120 bp  87.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r06  5S ribosomal RNA  85.59 
 
 
120 bp  87.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r09  5S ribosomal RNA  85.59 
 
 
120 bp  87.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_r10  5S ribosomal RNA  85.59 
 
 
120 bp  87.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0337949  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0070  5S ribosomal RNA  85.59 
 
 
115 bp  87.7  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.865708  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R16  5S ribosomal RNA  85.59 
 
 
115 bp  87.7  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14569  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R45  5S ribosomal RNA  85.59 
 
 
115 bp  87.7  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.161753  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R5  5S ribosomal RNA  85.59 
 
 
115 bp  87.7  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.378855  normal  0.842536 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R56  5S ribosomal RNA  85.59 
 
 
115 bp  87.7  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R6  5S ribosomal RNA  85.59 
 
 
115 bp  87.7  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.305961  normal  0.845216 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R77  5S ribosomal RNA  85.59 
 
 
115 bp  87.7  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0568785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R90  5S ribosomal RNA  85.59 
 
 
115 bp  87.7  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000508356  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0078  5S ribosomal RNA  85.59 
 
 
115 bp  87.7  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0012  5S ribosomal RNA  85.59 
 
 
120 bp  87.7  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34851  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55080  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 
118 bp  85.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55020  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 
118 bp  85.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55050  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 
118 bp  85.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55150  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 
118 bp  85.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA17  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 
115 bp  85.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0237431 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA48  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 
115 bp  85.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.929438  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA70  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 
115 bp  85.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA78  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 
115 bp  85.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA79  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 
115 bp  85.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0223502 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA8  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 
115 bp  85.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55120  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 
118 bp  85.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_55090  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 
118 bp  85.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0023  5S ribosomal RNA  85.58 
 
 
120 bp  81.8  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0013  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0102843 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0135  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
116 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0138  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.571697 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0119  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0024  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0006  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0003  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0028  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000458962 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0127  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
116 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0003  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000245604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0090  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0029  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0009  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0900632  hitchhiker  0.000000917011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0032  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000134368 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0069  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.733499  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0012  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0140  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.626199  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0127  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0003  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
116 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0010  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
116 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0029  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
116 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0025  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
116 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0004  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.13622  unclonable  0.0000114116 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0138  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
116 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0078  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
113 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0594811  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0020  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0035  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0030  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000472199 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0012  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0075039 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0035  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
116 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0147  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0042  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.190599  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0019  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0404714  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0016  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000743511 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_R0006  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000035078 
 
 
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NC_011663  Sbal223_R0026  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0619749 
 
 
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NC_011663  Sbal223_R0021  5S ribosomal RNA  86.81 
 
 
115 bp  79.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.973202  normal  0.0141597 
 
 
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