20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2104 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2104  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  839    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0344  hypothetical protein  41 
 
 		 417 aa  318  7.999999999999999e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0687151  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1676  hypothetical protein  38.5 
 
 		 410 aa  317  3e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.539323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3328  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  39.8 
 
 		 405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.703732  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2369  hypothetical protein  35.05 
 
 		 413 aa  262  6.999999999999999e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0444  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  39.34 
 
 		 360 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1035  hypothetical protein  31.62 
 
 		 411 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2265  hypothetical protein  32.84 
 
 		 372 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0678841  normal  0.713238 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1978  hypothetical protein  28.17 
 
 		 398 aa  179  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0514587  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2096  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  27.18 
 
 		 401 aa  166  5e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.735031  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2261  hypothetical protein  31.55 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0477  hypothetical protein  25 
 
 		 435 aa  152  8e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00460  hypothetical protein  28.86 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.131155  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02430  hypothetical protein  26.99 
 
 		 353 aa  124  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0596996  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1990  hypothetical protein  24.52 
 
 		 351 aa  90.5  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1685  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component-like protein  21.2 
 
 		 291 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.516639  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4911  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 333 aa  49.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224202  normal  0.316622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 336 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 349 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.27 
 
 		 336 aa  43.1  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>