23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1814 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1814  putative phage baseplate assembly protein  100 
 
 		 172 aa  353  5.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2253  bacteriophage Mu Gp45 protein  38.73 
 
 		 177 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000590369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2250  bacteriophage Mu Gp45 protein  38.73 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.217214 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4479  bacteriophage Mu Gp45 protein  38.73 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023741 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2586  phage baseplate assembly protein V  35.8 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0640174 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1046  phage baseplate assembly protein V  43.61 
 
 		 197 aa  104  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3735  Phage-related baseplate assembly protein V  40.28 
 
 		 193 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1872  phage baseplate assembly protein V  36.97 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1160  Phage baseplate assembly protein V  38.68 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2700  prophage MuSo2, baseplate assembly protein V  33.61 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4589  Phage baseplate assembly protein V  36.97 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3049  putative baseplate assembly protein Gp45,Mu-like  29.41 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179717 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0187  phage baseplate assembly protein V  37.11 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0743  bacteriophage Mu Gp45 protein  29.53 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0694  bacteriophage Mu Gp45 protein  29.53 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3862  phage assembly protein, putative  35.85 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0746  phage baseplate assembly protein V  27.42 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3115  Mu Gp45 domain-containing protein  27.93 
 
 		 197 aa  57.4  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2813  phage baseplate assembly protein V  29.27 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2735  phage baseplate assembly protein  29.27 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1471  phage baseplate assembly protein  29.27 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.388674 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2086  bacteriophage Mu Gp45 protein  28.32 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01988  hypothetical protein  29.73 
 
 		 212 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>