18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0418 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0418  paREP10  100 
 
 		 52 aa  108  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0562  paREP10  88.46 
 
 		 57 aa  101  4e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0121  paREP10  93.88 
 
 		 57 aa  99.4  2e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1970  hypothetical protein  84.62 
 
 		 57 aa  84  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2303  paREP10  60 
 
 		 50 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0116665 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1946  paREP10  58 
 
 		 53 aa  65.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.321574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1845  paREP10  60.42 
 
 		 55 aa  65.5  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0876357 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0720  paREP10  56.25 
 
 		 55 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0601  hypothetical protein  69.23 
 
 		 56 aa  60.5  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2041  hypothetical protein  57.14 
 
 		 62 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1275  paREP10  65.79 
 
 		 55 aa  58.2  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000837585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1208  paREP10  60.98 
 
 		 57 aa  57.4  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.616973 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1162  paREP10  64.1 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000216847 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0606  paREP10  54.17 
 
 		 54 aa  50.4  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2087  hypothetical protein  46.94 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.195493 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0811  paREP10  51.06 
 
 		 55 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0613  paREP10  46.94 
 
 		 56 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.696889 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1575  paREP10  48.94 
 
 		 54 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>