18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2307 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0716  hypothetical protein  62.13 
 
 
536 aa  697    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.403776 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2078  hypothetical protein  60.82 
 
 
535 aa  657    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2307  hypothetical protein  100 
 
 
536 aa  1072    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00335528 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1950  hypothetical protein  61.94 
 
 
536 aa  640    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0450  membrane protein-like protein  26.87 
 
 
589 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.336439  normal  0.520524 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0544  membrane protein-like  24.66 
 
 
544 aa  80.9  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0620  membrane protein-like protein  22.16 
 
 
581 aa  74.7  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0030  hypothetical protein  23 
 
 
619 aa  66.2  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00669856  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0934  FAD dependent oxidoreductase  22.69 
 
 
576 aa  64.7  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0753636 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1444  Protein of unknown function DUF2070, membrane  21.21 
 
 
566 aa  63.2  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2422  hypothetical protein  23.12 
 
 
618 aa  62.4  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.396799  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1657  hypothetical protein  23.73 
 
 
578 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0652307 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1087  hypothetical protein  25.23 
 
 
578 aa  60.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113336  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0076  hypothetical protein  25.94 
 
 
580 aa  60.8  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0190792  normal  0.314766 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0860  hypothetical protein  24.15 
 
 
579 aa  59.7  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.781635  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0196  hypothetical protein  26.33 
 
 
583 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.814189  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0167  Protein of unknown function DUF2070, membrane  24.44 
 
 
538 aa  49.7  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0680  hypothetical protein  23.6 
 
 
533 aa  46.2  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000787674  hitchhiker  0.00000670884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>