17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2303 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2303  paREP10  100 
 
 
50 aa  102  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0116665 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1946  paREP10  66 
 
 
53 aa  70.9  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.321574  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0720  paREP10  55.32 
 
 
55 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0418  paREP10  60 
 
 
52 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0121  paREP10  68.18 
 
 
57 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0562  paREP10  58 
 
 
57 aa  65.1  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2041  hypothetical protein  72.5 
 
 
62 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1845  paREP10  61.7 
 
 
55 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0876357 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1162  paREP10  64.86 
 
 
62 aa  53.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000216847 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1208  paREP10  58.54 
 
 
57 aa  53.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.616973 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0601  hypothetical protein  58.97 
 
 
56 aa  52.8  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1275  paREP10  62.16 
 
 
55 aa  51.6  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000837585  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1970  hypothetical protein  54 
 
 
57 aa  50.4  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2087  hypothetical protein  47.92 
 
 
99 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.195493 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0606  paREP10  54.17 
 
 
54 aa  48.5  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0811  paREP10  42.55 
 
 
55 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1575  paREP10  43.75 
 
 
54 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>