60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2146 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2146  siroheme-sulfite reductase gamma subunit-like protein  100 
 
 		 112 aa  231  3e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1963  siroheme-sulfite reductase gamma subunit-like protein  66.96 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0558809  hitchhiker  0.00000000000146375 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1083  siroheme-sulfite reductase gamma subunit-like protein  63.06 
 
 		 112 aa  160  6e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.854921  normal  0.0420669 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1227  DsrC family protein  36.7 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.214898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1442  DsrC family protein  35.78 
 
 		 111 aa  72  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.486208 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0910  DsrC family protein  36.7 
 
 		 111 aa  67  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0347  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  37.61 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0220542 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0168  DsrC family protein  37.61 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1632  DsrC-like protein  37.8 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0261  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  30.77 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0856  DsrC family protein  32.41 
 
 		 114 aa  55.1  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0035  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  34.57 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3197  DsrC family protein  28.43 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1481  sulfur transfer protein TusE  31.13 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0185238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1077  sulfur transfer protein TusE  28.7 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00172149  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1083  sulfur transfer protein TusE  28.7 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000029188  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2627  sulfur transfer protein TusE  28.7 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0586166  hitchhiker  0.0000185004 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00973  predicted sulfite reductase subunit  28.7 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0364521  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1522  DsrC family protein  29.03 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0907528  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1133  sulfur transfer protein TusE  28.7 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.74554 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1658  DsrC family protein  28.09 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2347  sulfur transfer protein TusE  28.7 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.159053  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00980  hypothetical protein  28.7 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0687839  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2674  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  28.7 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000927643  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2455  DsrC-like protein  30.34 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000476368  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2150  sulfur transfer protein TusE  28.7 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal  0.484844 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0077  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  30.86 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595568 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0635  DsrC-like protein  30.59 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218073  normal  0.311208 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1778  DsrC-like protein  33.8 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204977  normal  0.0463669 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0035  sulfite reductase, dissimilatory-type, gamma subunit  27.78 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000000508845  normal  0.0334015 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1196  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  27.06 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270848 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2658  DsrC -like protein  29.06 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2322  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  27.78 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000301643  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1042  sulfur transfer protein TusE  30.43 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.435905  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1193  sulfur transfer protein TusE  30.43 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1147  sulfur transfer protein TusE  30.43 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.085145  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1159  sulfur transfer protein TusE  30.43 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.240389  normal  0.524036 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0762  dissimilatory sulfite reductase, gamma subunit  25 
 
 		 105 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1125  sulfur transfer protein TusE  30.43 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.84282e-21 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2107  DsrC family protein  26.85 
 
 		 109 aa  42.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0048  DsrC family protein  27.27 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000243579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2847  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  32.18 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102705  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1334  intracellular sulfur oxidation protein DsrC  28.89 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2538  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  31.03 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.023632  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1220  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  30.43 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0127  DsrC family protein  26.36 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1471  sulfur oxidation protein of DsrC family protein  28.74 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.438377 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0693  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  25.56 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113713  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2529  sulfurtransferase TusE  30.43 
 
 		 109 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.248983  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2618  TusE/DsrC/DsvC family sulfur relay protein  30.43 
 
 		 109 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1858  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  27.78 
 
 		 111 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000483369  normal  0.0744764 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2190  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  26.14 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.277323  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2280  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  27.66 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1957  sulfite reductase, dissimilatory-type, gamma subunit  27.27 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000351468  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2958  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  27.06 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3341  hypothetical protein  27.78 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.184843  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0028  sulfur relay protein, TusE/DsrC/DsvC family  24.44 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.46834  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1956  DsrC family protein  25.29 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1705  hypothetical protein  27.93 
 
 		 108 aa  40  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.826446  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3037  DsrC family protein  27.16 
 
 		 104 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0059771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>