18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2041 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2041  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  126  9.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1845  paREP10  67.39 
 
 
55 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0876357 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2303  paREP10  72.5 
 
 
50 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0116665 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0720  paREP10  60.87 
 
 
55 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0562  paREP10  61.22 
 
 
57 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1946  paREP10  65.22 
 
 
53 aa  60.5  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.321574  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0121  paREP10  64.44 
 
 
57 aa  60.1  0.000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0418  paREP10  57.14 
 
 
52 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1208  paREP10  64.1 
 
 
57 aa  55.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.616973 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1162  paREP10  72.22 
 
 
62 aa  55.5  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000216847 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0601  hypothetical protein  66.67 
 
 
56 aa  53.9  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1275  paREP10  63.89 
 
 
55 aa  53.5  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000837585  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1970  hypothetical protein  57.14 
 
 
57 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0606  paREP10  61.54 
 
 
54 aa  46.6  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1575  paREP10  52.27 
 
 
54 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0613  paREP10  52.27 
 
 
56 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.696889 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2087  hypothetical protein  51.22 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.195493 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0811  paREP10  48.72 
 
 
55 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>