18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0668 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0668  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  100 
 
 		 60 aa  122  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1613  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  78.43 
 
 		 65 aa  89  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.877119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0638  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  81.25 
 
 		 54 aa  85.5  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0536  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  68 
 
 		 58 aa  78.6  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1956  CopG family transcriptional regulator  58 
 
 		 68 aa  65.9  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0593  CopG family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0399  CopG family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.347703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1563  CopG family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0796  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2824  putative transcriptional regulator, CopG family  42.22 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0168  putative transcriptional regulator, CopG family  42.86 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2407  putative transcriptional regulator, CopG family  41.67 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0981  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  37.78 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0146172  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0102  CopG family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.433684  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0524  putative transcriptional regulator, CopG family  34.09 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221557  normal  0.567376 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1473  CopG family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.297007  normal  0.896918 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1400  putative transcriptional regulators, CopG/Arc/MetJ family  40.48 
 
 		 50 aa  41.2  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.562472  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2232  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 48 aa  40.4  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000030214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>