16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0613 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0613  paREP10  100 
 
 
56 aa  110  6e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.696889 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1575  paREP10  62.96 
 
 
54 aa  72  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0811  paREP10  65.96 
 
 
55 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0606  paREP10  64.58 
 
 
54 aa  65.5  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1208  paREP10  60.53 
 
 
57 aa  52.4  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.616973 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1845  paREP10  54.17 
 
 
55 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0876357 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1275  paREP10  62.16 
 
 
55 aa  49.3  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000837585  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0601  hypothetical protein  57.89 
 
 
56 aa  48.5  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1162  paREP10  62.16 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000216847 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0562  paREP10  48.98 
 
 
57 aa  47.8  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0418  paREP10  46.94 
 
 
52 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0720  paREP10  47.92 
 
 
55 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0121  paREP10  47.83 
 
 
57 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1946  paREP10  52.08 
 
 
53 aa  44.3  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.321574  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2041  hypothetical protein  52.27 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2087  hypothetical protein  50 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.195493 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>