10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0579 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0579  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  330  5e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0591211  normal  0.536359 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1859  hypothetical protein  58.06 
 
 
156 aa  184  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000532381  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0625  hypothetical protein  58.28 
 
 
161 aa  179  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.45184  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0597  hypothetical protein  54.84 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1593  hypothetical protein  56.08 
 
 
157 aa  165  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.338031 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1786  hypothetical protein  54 
 
 
154 aa  165  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0724  hypothetical protein  54.84 
 
 
161 aa  154  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3003  hypothetical protein  45.7 
 
 
171 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1095  rubrerythrin  29.19 
 
 
160 aa  50.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0008947 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1973  hypothetical protein  29.73 
 
 
345 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.311913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>