48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04076 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03602  ISXoo3 transposase ORF A  100 
 
 
264 bp  250  7e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.485987  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04076    100 
 
 
126 bp  250  7e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.543634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04077  transposase  100 
 
 
498 bp  250  7e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.411546  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04312  transposase  100 
 
 
285 bp  248  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03025  ISXoo3 transposase ORF A  99.21 
 
 
264 bp  242  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.752388  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02555  ISXoo3 transposase ORF A  98.41 
 
 
264 bp  234  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.104602  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02528  ISXoo3 transposase ORF A  98.41 
 
 
264 bp  234  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02393  ISXoo3 transposase ORF A  98.41 
 
 
264 bp  234  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.567997  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02653    98.41 
 
 
204 bp  234  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03998  ISXoo3 transposase ORF A  98.41 
 
 
264 bp  234  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04438  ISXoo3 transposase ORF A  98.41 
 
 
270 bp  234  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02901  ISXoo3 transposase ORF A  98.41 
 
 
264 bp  234  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04490  ISXoo3 transposase ORF A  98.41 
 
 
264 bp  234  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00713  transposase  98.41 
 
 
264 bp  234  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0015797  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00699  ISXoo3 transposase ORF A  98.41 
 
 
264 bp  234  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722368  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05698  IS66 family element, Orf1 protein  98.41 
 
 
204 bp  234  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0455822  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03797  transposase  98.41 
 
 
450 bp  234  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03931  ISXoo3 transposase ORF A  97.62 
 
 
264 bp  226  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02942  ISXoo3 transposase ORF A  97.62 
 
 
264 bp  226  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0664687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04016  ISXoo3 transposase ORF A  97.62 
 
 
264 bp  226  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03197  ISXoo3 transposase ORF A  97.62 
 
 
264 bp  226  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.818728  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01959  ISXoo3 transposase ORF A  97.62 
 
 
264 bp  226  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0236899  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02163  hypothetical protein  98.41 
 
 
147 bp  226  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04193  ISXoo3 transposase ORF A  97.62 
 
 
264 bp  226  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01538  ISXoo3 transposase ORF A  97.62 
 
 
264 bp  226  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.297821  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01162  transposase  97.62 
 
 
126 bp  226  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01074  ISXoo3 transposase ORF A  97.62 
 
 
264 bp  226  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270456  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05705  IS66 family element, Orf1 protein, putative  98.41 
 
 
399 bp  226  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06245  ISXoo3 transposase ORF A  97.62 
 
 
264 bp  226  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.311996  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02742  ISXoo3 transposase ORF A  96.83 
 
 
264 bp  218  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05448  IS66 family element, Orf1 protein, putative  97.62 
 
 
399 bp  218  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05777  IS66 family element, Orf1 protein, putative  97.62 
 
 
393 bp  218  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03722  hypothetical protein  97.62 
 
 
147 bp  218  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03279  ISXoo3 transposase ORF A  96.83 
 
 
264 bp  218  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.351629  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02779  hypothetical protein  97.62 
 
 
147 bp  218  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02572  ISXoo3 transposase ORF A  96.83 
 
 
264 bp  218  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02483  ISXoo3 transposase ORF A  96.83 
 
 
264 bp  218  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01847  ISXoo3 transposase ORF A  96.83 
 
 
264 bp  218  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01543  ISXoo3 transposase ORF A  96.03 
 
 
264 bp  210  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00733  ISXoo3 transposase ORF A  96.03 
 
 
264 bp  210  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.632104  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01934  ISXoo3 transposase ORF A  95.73 
 
 
774 bp  192  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00237  transposase  87.3 
 
 
237 bp  123  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01379  hypothetical protein  93.33 
 
 
216 bp  109  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1332  putative transposase IS3/IS911  91.11 
 
 
264 bp  58  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1610  transposase IS3/IS911 family protein  91.67 
 
 
294 bp  48.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1093  transposase IS3/IS911 family protein  91.67 
 
 
255 bp  48.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1133  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  96.3 
 
 
1584 bp  46.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.740048  hitchhiker  0.000205142 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4004    91.43 
 
 
204 bp  46.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.490255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>