49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5589 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5589  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  669    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5110  SdiA-regulated  77.47 
 
 		 326 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07110  hypothetical protein  39.58 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187526  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04270  putative transcriptional regulator  39.21 
 
 		 321 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0418  hypothetical protein  38.71 
 
 		 321 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5204  SdiA-regulated domain-containing protein  38.03 
 
 		 300 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4227  SdiA-regulated domain-containing protein  36.04 
 
 		 303 aa  185  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0314  SdiA-regulated domain-containing protein  39.01 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5151  SdiA-regulated domain protein  40 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.965879  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5058  SdiA-regulated domain-containing protein  40 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0993064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4848  SdiA-regulated  40 
 
 		 317 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22840  SdiA-regulated domain-containing protein  37.78 
 
 		 308 aa  175  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0239521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5383  SdiA-regulated  36.93 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5290  hypothetical protein  38.61 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.842454  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4229  SdiA-regulated domain-containing protein  36.22 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0313  SdiA-regulated domain-containing protein  36.33 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3272  SdiA-regulated protein  38.54 
 
 		 325 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5059  SdiA-regulated domain-containing protein  35.99 
 
 		 306 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5152  SdiA-regulated domain protein  35.9 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5205  SdiA-regulated domain-containing protein  36.31 
 
 		 305 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04160  putatitve transcriptional regulator  37.14 
 
 		 329 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0412  putatitve transcriptional regulator  34.77 
 
 		 310 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5291  hypothetical protein  31.96 
 
 		 310 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38420  hypothetical protein  36.46 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224716 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48290  hypothetical protein  36.67 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5384  SdiA-regulated  36.1 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4849  SdiA-regulated  30.67 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4573  sdiA-regulated family protein  35.69 
 
 		 286 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4706  SdiA-regulated family protein  35.69 
 
 		 286 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4657  hypothetical protein  35.69 
 
 		 301 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4658  hypothetical protein  35.29 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4566  hypothetical protein  35.29 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.859711  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4878  SdiA-regulated protein  29.32 
 
 		 329 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.60346 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5845  SdiA-regulated protein  29.44 
 
 		 280 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.539509 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4933  hypothetical protein  29.44 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4561  hypothetical protein  28.63 
 
 		 323 aa  122  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04202  hypothetical protein  28.63 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04165  hypothetical protein  28.63 
 
 		 322 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00151161  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3731  SdiA-regulated domain-containing protein  28.51 
 
 		 286 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00663861  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3663  SdiA-regulated domain protein  28.63 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000154748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4772  conserved hypothetical protein yjiK  28.23 
 
 		 323 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4679  hypothetical protein  28.28 
 
 		 282 aa  96.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5082  sdiA-regulated domain protein  28.69 
 
 		 272 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.142061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4588  SrgB  27.33 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.537966  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0044  SrgB  27.33 
 
 		 282 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.880775 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2428  hypothetical protein  28.63 
 
 		 302 aa  90.9  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0451472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1385  putative extracellular nuclease  24.59 
 
 		 751 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14292  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1215  inner membrane protein  24.79 
 
 		 280 aa  50.1  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1269  inner membrane protein  26.5 
 
 		 268 aa  43.5  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>