16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1350 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1350  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  809    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1771  hypothetical protein  50.38 
 
 		 401 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219418  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2164  M48 family peptidase  33.07 
 
 		 403 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.777176 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2995  peptidase M48 Ste24p  26.07 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104331  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1907  peptidase M48, Ste24p  25.59 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.271345 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0412  peptidase M48 Ste24p  26.92 
 
 		 291 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0423  peptidase M48 Ste24p  26.92 
 
 		 291 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1287  peptidase M48 Ste24p  27.62 
 
 		 291 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.899004 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4501  peptidase M48  25.64 
 
 		 324 aa  47.8  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.274182  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0637  peptidase M48  24.87 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0399964  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3146  peptidase M48, Ste24p  24.57 
 
 		 320 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.374464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2454  peptidase M48 Ste24p  29.11 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.477087  normal  0.138125 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2723  peptidase M48 Ste24p  24.21 
 
 		 320 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3380  peptidase M48 Ste24p  24.21 
 
 		 320 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1553  peptidase M48 Ste24p  28.49 
 
 		 344 aa  43.1  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.955824  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3361  peptidase M48 Ste24p  26.34 
 
 		 351 aa  43.1  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>