20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1114 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1114  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0954  hypothetical protein  98.65 
 
 		 74 aa  150  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4743  hypothetical protein  86.3 
 
 		 101 aa  135  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369246  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1819  hypothetical protein  74.24 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0698228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2546  hypothetical protein  69.57 
 
 		 115 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.211724  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0137  hypothetical protein  71.64 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2221  hypothetical protein  69.7 
 
 		 95 aa  103  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003649  hypothetical protein  69.23 
 
 		 69 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.13895  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3321  hypothetical protein  62.32 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4057  hypothetical protein  68.18 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2318  hypothetical protein  64.18 
 
 		 100 aa  101  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0856  hypothetical protein  58.21 
 
 		 97 aa  98.6  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2552  hypothetical protein  61.19 
 
 		 96 aa  97.1  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1930  hypothetical protein  61.97 
 
 		 100 aa  96.7  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1958  hypothetical protein  62.12 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.781957  normal  0.865529 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2938  protein of unknown function UPF0153  43.28 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0781616  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04095  hypothetical protein  40.74 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2539  protein of unknown function UPF0153  44.19 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4386  protein of unknown function UPF0153  35.56 
 
 		 228 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  0.783994 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1877  hypothetical protein  53.12 
 
 		 224 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>