32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0869 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0869  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  246  7e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1450  hypothetical protein  90.08 
 
 		 120 aa  222  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176876 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59860  putative type III effector Hop protein  59.62 
 
 		 119 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114799  hitchhiker  0.000000000000152109 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36200  Plasmid hypothetical protein, RAQPRD  59.22 
 
 		 118 aa  117  6e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4507  hypothetical protein  56.6 
 
 		 112 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2851  plasmid conserved hypothetical protein RAQPRD  48.24 
 
 		 116 aa  87  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.410832  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1406  putative secreted protein  43.56 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0449246  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1634  hypothetical protein  45.95 
 
 		 126 aa  84  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1264  hypothetical protein  45.83 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2345  hypothetical protein  45.83 
 
 		 127 aa  84  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000024781  unclonable  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1172  plasmid conserved hypothetical protein RAQPRD  43.14 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3015  hypothetical protein  46.08 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4171  hypothetical protein  44.33 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0787775  normal  0.908625 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0443  hypothetical protein  42.11 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3416  hypothetical protein  43.75 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199537  normal  0.0728248 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1192  hypothetical protein  42.71 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0476297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0956  hypothetical protein  48.65 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2194  hypothetical protein  41.35 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2386  hypothetical protein  44.44 
 
 		 115 aa  72.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2940  hypothetical protein  41.58 
 
 		 119 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0675  hypothetical protein  46.05 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1975  hypothetical protein  40.86 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.793487  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3322  hypothetical protein  47.5 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.840275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0652  hypothetical protein  34.74 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0510  hypothetical protein  36.96 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3713  hypothetical protein  32.89 
 
 		 102 aa  52.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0368  hypothetical protein  46.81 
 
 		 203 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0329  hypothetical protein  36.25 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4094  hypothetical protein  37.5 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4177  hypothetical protein  37.5 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1756  hypothetical protein  36.76 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0640  hypothetical protein  34.25 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>