13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0841 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0841    100 
 
 		 465 bp  922    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1426  hypothetical protein  83.27 
 
 		 1539 bp  176  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36380  hypothetical protein  90.91 
 
 		 1566 bp  56  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2838  hypothetical protein  100 
 
 		 423 bp  52  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102813  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  100 
 
 		 489 bp  52  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0582  hypothetical protein  88 
 
 		 1515 bp  52  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2179  hypothetical protein  88 
 
 		 1524 bp  52  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.384212  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0041  hypothetical protein  100 
 
 		 387 bp  50.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3214    100 
 
 		 1719 bp  48.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3653    100 
 
 		 210 bp  48.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0544552  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4996  hypothetical protein  100 
 
 		 2922 bp  48.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2360  hypothetical protein  87.23 
 
 		 1548 bp  46.1  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000403378  unclonable  0.000000201998 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1391  hypothetical protein  91.43 
 
 		 1524 bp  46.1  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>