21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0120 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0120  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  797    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0067  hypothetical protein  94.05 
 
 		 397 aa  713    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5084  hypothetical protein  71.05 
 
 		 340 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0424557 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0161  hypothetical protein  70.18 
 
 		 341 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0159  hypothetical protein  69.88 
 
 		 340 aa  494  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860597 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0143  hypothetical protein  69.59 
 
 		 341 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109428  normal  0.11094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0036  hypothetical protein  67.75 
 
 		 342 aa  483  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326703  normal  0.177153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6275  hypothetical protein  65.87 
 
 		 340 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72300  hypothetical protein  64.97 
 
 		 346 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2156  hypothetical protein  62.69 
 
 		 341 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00627834  normal  0.0979823 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01770  hypothetical protein  59.09 
 
 		 337 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3543  hypothetical protein  53.92 
 
 		 365 aa  300  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.571666  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2394  hypothetical protein  45.35 
 
 		 376 aa  286  5e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2318  hypothetical protein  31.63 
 
 		 130 aa  57  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000668387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2048  hypothetical protein  29.92 
 
 		 133 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000179688  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0714  hypothetical protein  28.65 
 
 		 369 aa  51.2  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1796  hypothetical protein  29.46 
 
 		 137 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00914712  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0597  hypothetical protein  29.25 
 
 		 157 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0953  hypothetical protein  27.59 
 
 		 114 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2688  hypothetical protein  25.55 
 
 		 135 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000329796 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1528  hypothetical protein  26.28 
 
 		 135 aa  43.1  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.238121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>