15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5250 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5250  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  267  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61000  hypothetical protein  90.28 
 
 
144 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3166  hypothetical protein  56.12 
 
 
148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2513  hypothetical protein  54.68 
 
 
148 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0764  hypothetical protein  45.45 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.503732  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03856  hypothetical protein  45.45 
 
 
147 aa  108  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.857117  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0620  hypothetical protein  44.06 
 
 
146 aa  106  9.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13541  hypothetical protein  43.36 
 
 
147 aa  104  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4061  hypothetical protein  35.92 
 
 
148 aa  103  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1023  hypothetical protein  39.42 
 
 
152 aa  101  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2694  hypothetical protein  39.86 
 
 
166 aa  84.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1989  hypothetical protein  42.62 
 
 
137 aa  47.4  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.198765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3235  hypothetical protein  38.71 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.980786  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1734  hypothetical protein  30.61 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  36.21 
 
 
310 aa  40  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>