23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4440 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4440  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58950  hypothetical protein  84.29 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000821511  hitchhiker  0.0089771 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4295  hypothetical protein  43.16 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2804  hypothetical protein  40.38 
 
 		 103 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.27938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2204  hypothetical protein  39.81 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000075026  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2575  GP46  36.7 
 
 		 110 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.029841  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0758  GP46  38.24 
 
 		 106 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00217936  unclonable  0.00000966346 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2002  GP46  35.83 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00138731  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1960  GP46  38.61 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  0.0379275 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0728  GP46  38.61 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00505701  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3271  GP46  38.61 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183285  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3507  GP46  38.61 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0774755  hitchhiker  0.00450512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1845  GP46  38.61 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00167765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3382  GP46  38.61 
 
 		 106 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000163706  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1953  GP46  37.62 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000678855  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3408  GP46  37.62 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559716  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0089  hypothetical protein  32.71 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58940  hypothetical protein  78.79 
 
 		 49 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000483942  hitchhiker  0.00765575 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1661  hypothetical protein  33.67 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0760524  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1015  gp41  34 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0684412  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3275  GP46  34 
 
 		 107 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000845593  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1656  hypothetical protein  34.74 
 
 		 521 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2829  hypothetical protein  31.58 
 
 		 104 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.705107 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>