47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3272 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3272  SdiA-regulated protein  100 
 
 		 325 aa  642    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38420  hypothetical protein  86.69 
 
 		 309 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4227  SdiA-regulated domain-containing protein  52.63 
 
 		 303 aa  292  5e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04270  putative transcriptional regulator  54.26 
 
 		 321 aa  275  9e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0418  hypothetical protein  54.26 
 
 		 321 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5383  SdiA-regulated  47.73 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02449 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5290  hypothetical protein  51.23 
 
 		 312 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.842454  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4848  SdiA-regulated  54.3 
 
 		 317 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5204  SdiA-regulated domain-containing protein  49.84 
 
 		 300 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22840  SdiA-regulated domain-containing protein  52.35 
 
 		 308 aa  259  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0239521  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5058  SdiA-regulated domain-containing protein  50.88 
 
 		 300 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0993064  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5151  SdiA-regulated domain protein  50.88 
 
 		 300 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.965879  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0314  SdiA-regulated domain-containing protein  48.21 
 
 		 303 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4849  SdiA-regulated  35.83 
 
 		 314 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04160  putatitve transcriptional regulator  34.87 
 
 		 329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5059  SdiA-regulated domain-containing protein  39.05 
 
 		 306 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5152  SdiA-regulated domain protein  38.46 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0412  putatitve transcriptional regulator  35.2 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0313  SdiA-regulated domain-containing protein  37.96 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5205  SdiA-regulated domain-containing protein  38.1 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5110  SdiA-regulated  37.87 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4229  SdiA-regulated domain-containing protein  37.1 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4566  hypothetical protein  36.57 
 
 		 301 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.859711  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4658  hypothetical protein  36.19 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5589  hypothetical protein  37.38 
 
 		 326 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4573  sdiA-regulated family protein  36.3 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4706  SdiA-regulated family protein  36.3 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4657  hypothetical protein  35.82 
 
 		 301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07110  hypothetical protein  37.68 
 
 		 317 aa  166  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187526  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5291  hypothetical protein  34.44 
 
 		 310 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48290  hypothetical protein  38.65 
 
 		 305 aa  162  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5384  SdiA-regulated  35.21 
 
 		 307 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5845  SdiA-regulated protein  33.98 
 
 		 280 aa  155  9e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.539509 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4933  hypothetical protein  30.23 
 
 		 323 aa  152  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4878  SdiA-regulated protein  29.87 
 
 		 329 aa  152  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.60346 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4561  hypothetical protein  32.55 
 
 		 323 aa  149  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3731  SdiA-regulated domain-containing protein  29.22 
 
 		 286 aa  149  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00663861  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04202  hypothetical protein  32.55 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04165  hypothetical protein  32.55 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00151161  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3663  SdiA-regulated domain protein  32.55 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000154748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4772  conserved hypothetical protein yjiK  28.9 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0044  SrgB  34.75 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.880775 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4588  SrgB  34.75 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.537966  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4679  hypothetical protein  34.43 
 
 		 282 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5082  sdiA-regulated domain protein  28.45 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.142061 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2428  hypothetical protein  30.65 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0451472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1385  putative extracellular nuclease  23.67 
 
 		 751 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14292  normal  0.827149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>