15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2791 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2791  putative filamentous haemagglutinin  100 
 
 
319 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.258369  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2787  filamentous haemagglutinin  48.74 
 
 
980 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  49.57 
 
 
5212 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  49.57 
 
 
3563 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  35.4 
 
 
6274 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3210  filamentous hemagglutinin family protein  43.97 
 
 
991 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  33.33 
 
 
3443 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1532  putative filamentous haemagglutinin, intein-containing protein  33.33 
 
 
424 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0092129  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  30.43 
 
 
2449 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2782  hemagglutinin  43.36 
 
 
576 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0044  filamentous hemagglutinin  43.36 
 
 
2904 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  41.77 
 
 
288 aa  46.6  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02830  ParB-like nuclease  36.76 
 
 
410 aa  45.8  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0823901  hitchhiker  4.66219e-31 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3503  chromosome segregation DNA-binding protein  32.99 
 
 
300 aa  42.7  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.156732 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0070  ParB domain-containing protein  33.75 
 
 
222 aa  42.4  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>