32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0680 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0680  Gp5 domain-containing protein  100 
 
 
323 aa  655    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5076  Gp5 domain-containing protein  95.36 
 
 
323 aa  607  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0722  hypothetical protein  41.41 
 
 
321 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4920  hypothetical protein  65.14 
 
 
197 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0564  hypothetical protein  34.08 
 
 
364 aa  231  9e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.636902 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2779  phage protein  40.37 
 
 
567 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00246067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2914  phage protein  40.37 
 
 
567 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000301579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3470  phage protein  39.45 
 
 
567 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000394685 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2743  Gp5 domain-containing protein  36.87 
 
 
359 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1446  Gp5 domain-containing protein  36.87 
 
 
359 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0926  hypothetical protein  39.08 
 
 
565 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1032  hypothetical protein  36.5 
 
 
543 aa  208  9e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0918  hypothetical protein  35.96 
 
 
551 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0263  Gp5 domain protein  38.06 
 
 
360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.791542  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1049  hypothetical protein, putative phage gene  38.58 
 
 
541 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4921  hypothetical protein  64.8 
 
 
125 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05049  hypothetical protein  36.84 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0743  hypothetical protein  34.68 
 
 
231 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.104766 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1306  hypothetical protein  42.68 
 
 
178 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3389  baseplate assembly protein, putative  33.63 
 
 
240 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1305  hypothetical protein  43.1 
 
 
58 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1301  baseplate assembly protein, putative  26.67 
 
 
241 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000120428 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3654  baseplate assembly protein, putative  25.45 
 
 
250 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  28.19 
 
 
661 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  27.66 
 
 
661 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  27.66 
 
 
661 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  27.66 
 
 
661 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  27.66 
 
 
661 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  27.66 
 
 
661 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  27.66 
 
 
661 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  27.66 
 
 
661 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  25.41 
 
 
703 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>