14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5172 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5172  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.147523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5079  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215609  normal  0.98479 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0290  hypothetical protein  98.33 
 
 		 60 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.413626 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5232  hypothetical protein  98.33 
 
 		 60 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0193  hypothetical protein  95 
 
 		 60 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.813264  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0307  hypothetical protein  91.38 
 
 		 60 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0085  hypothetical protein  89.66 
 
 		 59 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03710  hypothetical protein  89.66 
 
 		 60 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000191808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0375  hypothetical protein  89.66 
 
 		 60 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981262  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4344  hypothetical protein  74.14 
 
 		 60 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31710  hypothetical protein  83.02 
 
 		 61 aa  90.9  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0621  hypothetical protein  47.73 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000560407  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4651  hypothetical protein  47.5 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0564  hypothetical protein  43.18 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.746632  normal  0.169391 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>