14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5060 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5060  hypothetical protein  100 
 
 		 1571 aa  3204    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4933  hypothetical protein  96.27 
 
 		 1530 aa  3021    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5111  hypothetical protein  31.55 
 
 		 1559 aa  647    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0405  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1555 aa  754    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.354945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4883  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1586 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.718638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5009  hypothetical protein  27.48 
 
 		 1586 aa  512  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5059  hypothetical protein  31.76 
 
 		 1565 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3453  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1527 aa  168  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3707  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1743 aa  78.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1768  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1742 aa  73.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0539  hypothetical protein  24.64 
 
 		 859 aa  55.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0266  hypothetical protein  43.24 
 
 		 1830 aa  48.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.639279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5119  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1076 aa  47.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0373  hypothetical protein  23.45 
 
 		 928 aa  45.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.223606  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>