25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3864 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3864  phage FluMu DNA circulation protein, putative  100 
 
 		 420 aa  843    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1158  DNA circulation-like  37.59 
 
 		 411 aa  256  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4591  DNA circulation, N-terminal  43.84 
 
 		 470 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422243  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0581  DNA circulation protein, putative  43.84 
 
 		 607 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519076  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3737  DNA circulation-like  33.71 
 
 		 415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2588  DNA circulation family protein  28.67 
 
 		 438 aa  160  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0328137 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4477  tail/DNA circulation protein  29.4 
 
 		 446 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305287 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2255  tail/DNA circulation protein  30.4 
 
 		 446 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000334711 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2252  tail/DNA circulation protein  30 
 
 		 446 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.257831 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3117  DNA circulation family protein  33.18 
 
 		 468 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3051  putative bacteriophage DNA circulation protein, Mu-like  29.85 
 
 		 475 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.273853  hitchhiker  0.000025391 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2737  putative DNA circulation protein  44 
 
 		 468 aa  94.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1469  putative DNA circulation protein  44 
 
 		 468 aa  94.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.539442 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2815  DNA circulation family protein  44 
 
 		 468 aa  94.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6587  putative Mu-like prophage DNA circulation protein  37.93 
 
 		 422 aa  87  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0189  DNA circulation family protein  25.91 
 
 		 439 aa  86.7  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1874  DNA circulation family protein  36.84 
 
 		 490 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000818097 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2698  prophage MuSo2, DNA circulation protein, putative  24.56 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0745  DNA circulation protein  35.33 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0692  DNA circulation protein  35.33 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0744  DNA circulation family protein  38.79 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4486  Mu-like prophage DNA circulation protein-like protein  34.13 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126188  normal  0.0913206 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1654  DNA circulation family protein  45.59 
 
 		 153 aa  72.4  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2449  putative Mu-like prophage DNA circulation protein  29.66 
 
 		 159 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2088  hypothetical protein  34.29 
 
 		 128 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>