26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3204 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3204  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2395  cupin 2 domain-containing protein  56.67 
 
 		 192 aa  204  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4825  cupin 2 domain-containing protein  52.38 
 
 		 198 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1938  hypothetical protein  53.85 
 
 		 191 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.73761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5492  transcriptional regulator protein  50 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3139  cupin 2 domain-containing protein  47.62 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3537  cupin 2, barrel  45.11 
 
 		 193 aa  151  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.579632  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5297  cupin 2 domain-containing protein  38.42 
 
 		 183 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1682  hypothetical protein  36.41 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.557508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1347  hypothetical protein  39.2 
 
 		 176 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835036  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1555  hypothetical protein  35.33 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4799  cupin 2 domain-containing protein  32.77 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.49808  normal  0.0689271 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06743  hydrolase, CocE/NonD family, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00600)  35.68 
 
 		 793 aa  99.4  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0144437 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3421  cupin 2 domain-containing protein  38.38 
 
 		 171 aa  97.8  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.357216  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3987  cupin 2 domain-containing protein  34.38 
 
 		 164 aa  93.2  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.966145  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3026  cupin 2 domain-containing protein  34.59 
 
 		 176 aa  91.7  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4528  cupin 2 domain-containing protein  30.86 
 
 		 175 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.42906  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07635  Putative uncharacterized proteinPutative uncharacterized protein binA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74707]  62.5 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.837301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5607  cupin 2 domain-containing protein  31.69 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1200  cupin 2 domain-containing protein  33.72 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.375289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1171  hypothetical protein  29.34 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1913  hypothetical protein  55.81 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.421142  normal  0.261472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4820  hypothetical protein  55.81 
 
 		 141 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0707469  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05730  hypothetical protein  30.77 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.26234  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3009  hypothetical protein  39.22 
 
 		 241 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04830  hypothetical protein  40.68 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>