12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2293 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2293  DNA maturase B  100 
 
 		 562 aa  1174    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0581957 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1680  Sel1 domain-containing protein  32.79 
 
 		 940 aa  124  5e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.428252 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  33.61 
 
 		 1281 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0951  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1141 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0544  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1134 aa  109  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.142127 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0717  hypothetical protein  31.88 
 
 		 1640 aa  100  9e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.168757 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0494  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1481 aa  97.4  6e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0955  hypothetical protein  30.22 
 
 		 1792 aa  89.4  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1378  hypothetical protein  24.51 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0014  hypothetical protein  29.11 
 
 		 484 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0266  hypothetical protein  24.32 
 
 		 500 aa  47.4  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0249  phage uncharacterized protein  23.33 
 
 		 527 aa  45.1  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>