20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1260 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1260  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13381  hypothetical protein  81.71 
 
 
83 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13531  hypothetical protein  72.29 
 
 
84 aa  128  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.430148  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13281  hypothetical protein  72.84 
 
 
81 aa  127  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12381  hypothetical protein  55.56 
 
 
81 aa  99.4  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.156899  normal  0.010521 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08351  hypothetical protein  53.09 
 
 
81 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0765  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.11271 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1597  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  89  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.241699  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0772  hypothetical protein  52.63 
 
 
77 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16131  hypothetical protein  52.63 
 
 
77 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2102  NAD-reducing hydrogenase gamma  38.36 
 
 
79 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.705334  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0197  ferredoxin  41.25 
 
 
79 aa  65.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.508683  normal  0.459083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3641  ferredoxin  45.21 
 
 
79 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0540  ferredoxin  41.33 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1627  ferredoxin  41.67 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1654  ferredoxin  41.67 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3956  ferredoxin  41.03 
 
 
77 aa  57.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0689877  normal  0.82843 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3856  ferredoxin  38.36 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.40418  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.29 
 
 
979 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1808  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  29.33 
 
 
904 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.406388  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>