16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_83561 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_83561  protein required for asparagine-linked oligosaccharide assembly  100 
 
 
606 aa  1253    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05725  alpha-1,2-mannosyltransferase (Alg11), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06890)  28.63 
 
 
585 aa  217  5e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00210  conserved hypothetical protein  28.84 
 
 
898 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0415353  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35087  predicted protein  32.92 
 
 
471 aa  200  5e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_54621  glycosyl transferase, family 1  30.5 
 
 
433 aa  188  3e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2037  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000383796 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1466  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
403 aa  75.1  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0810  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.286793  normal  0.59117 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0516  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
421 aa  73.2  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.628757  normal  0.125688 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1213  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
384 aa  64.3  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.033035 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0381  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 
411 aa  62  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1746  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
348 aa  60.1  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1739  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
355 aa  51.6  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1814  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 
348 aa  48.9  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.506026  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0184  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
359 aa  45.8  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1689  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
382 aa  44.7  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>