18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_70834 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_70834  membrane protein  100 
 
 		 216 aa  449  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.992962  normal  0.148402 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04446  endosomal cargo receptor (Erp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07390)  46.3 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05150  ER to Golgi transport-related protein, putative  36.41 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40322  emp24/gp25L/p24 family of membrane trafficking proteins  34.57 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.737059 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01154  endosomal cargo receptor (P24), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11470)  29.15 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.744526  normal  0.0934233 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00550  COPII-coated vesicle protein, putative  26.94 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33886  predicted protein  27.92 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0664063 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65279  predicted protein  26.03 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0213838  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00890  ER to Golgi transport-related protein, putative  26.27 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.53443  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04165  Endoplasmic reticulum vesicle protein 25 Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B5L5]  24.32 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91130  protein carrier activity  26.46 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.348207 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69039  predicted protein  22.22 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08194  endosomal cargo receptor (Erp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03260)  21.08 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0128552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38724  predicted protein  21.46 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.357366  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46215  predicted protein  32 
 
 		 297 aa  42.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.14689  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02890  ER to Golgi transport-related protein, putative  22.75 
 
 		 214 aa  42.4  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29045  predicted protein  30.56 
 
 		 267 aa  41.6  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31593  predicted protein  26.02 
 
 		 240 aa  41.6  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.316071  normal  0.762831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>