15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA00550 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA00550  COPII-coated vesicle protein, putative  100 
 
 		 194 aa  407  1e-113  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01154  endosomal cargo receptor (P24), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11470)  45.92 
 
 		 202 aa  174  9e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.744526  normal  0.0934233 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_91130  protein carrier activity  41.12 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.348207 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08194  endosomal cargo receptor (Erp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03260)  27.41 
 
 		 210 aa  94.7  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0128552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69039  predicted protein  26.42 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65279  predicted protein  28.99 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0213838  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04165  Endoplasmic reticulum vesicle protein 25 Precursor [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B5L5]  27.8 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70834  membrane protein  26.94 
 
 		 216 aa  74.3  0.0000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.992962  normal  0.148402 
 
 
-
 
NC_006686  CND05150  ER to Golgi transport-related protein, putative  25.36 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02890  ER to Golgi transport-related protein, putative  27.17 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04446  endosomal cargo receptor (Erp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07390)  26.5 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00890  ER to Golgi transport-related protein, putative  26.07 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.53443  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33886  predicted protein  27.85 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0664063 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46215  predicted protein  32.05 
 
 		 297 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.14689  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49630  predicted protein  26.63 
 
 		 247 aa  45.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0451842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>