14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_69154 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_69154  ran binding protein  100 
 
 		 1103 aa  2237    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0595728  normal  0.755477 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02120  importin subunit beta-4, putative (JCVI)  30.5 
 
 		 1093 aa  519  1.0000000000000001e-145  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00890  importin beta-4 subunit, putative  30.29 
 
 		 1080 aa  444  1e-123  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_23582  predicted protein  25.2 
 
 		 764 aa  180  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_25726  predicted protein  24.1 
 
 		 1015 aa  120  9.999999999999999e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779434  decreased coverage  0.000347416 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41924  predicted protein  22.34 
 
 		 979 aa  105  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.123239  normal  0.112463 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36650  predicted protein  22.34 
 
 		 979 aa  105  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0159374  normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69854  Karyopherin Functions in nuclear transport of proteins  20.74 
 
 		 1090 aa  97.1  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05717  importin beta-3 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06790)  22.22 
 
 		 1095 aa  95.9  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88418  karyopherin-beta  19.91 
 
 		 870 aa  52  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00906  Putative karyopherin/importin beta-1Putative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q7Z9L0]  22.2 
 
 		 872 aa  51.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00266285  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03370  protein carrier, putative  21.1 
 
 		 907 aa  50.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0220486  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00926  KapC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q2LD07]  21.13 
 
 		 939 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.335104  normal  0.533348 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80310  predicted protein  24.59 
 
 		 938 aa  48.9  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>