29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28111 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009068  PICST_28111  Zn-finger protein  100 
 
 
924 aa  1895    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.689755 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05870  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  30.16 
 
 
1012 aa  51.2  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.199976  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05700  hypothetical protein  23.71 
 
 
897 aa  50.4  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00568  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  29.03 
 
 
581 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.411727  normal  0.553294 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10105  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  24.66 
 
 
1119 aa  50.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.227022  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08177  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  40.38 
 
 
867 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.681278  normal  0.988868 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04096  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  38.3 
 
 
988 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.043907  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06846  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  24.41 
 
 
681 aa  48.9  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548011  normal  0.683069 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07820  Sterigmatocystin biosynthesis regulatory protein [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P52957]  35.19 
 
 
433 aa  48.1  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.105824 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05279  conserved hypothetical protein  29.82 
 
 
494 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00689  Acetate regulatory DNA binding protein FacBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13461]  44.44 
 
 
867 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04175  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  43.24 
 
 
973 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.163243  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02070  hypothetical protein  32.81 
 
 
869 aa  47  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30322  UME6 C6 zinc finger URS1-binding protein-like protein  29.49 
 
 
535 aa  46.2  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.727328  normal  0.128685 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08529  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  31.88 
 
 
391 aa  46.2  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.372324 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11185  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  39.47 
 
 
779 aa  45.8  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.298239 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01134  Quinic acid utilization activator [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P10563]  38.78 
 
 
825 aa  46.2  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.524826  normal  0.226407 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05924  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  33.33 
 
 
733 aa  45.8  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0146056  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11093  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  36.17 
 
 
624 aa  45.8  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118177  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08506  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  54.29 
 
 
768 aa  45.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.359432  normal  0.0268522 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03868  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  32.2 
 
 
692 aa  45.4  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.435009  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03820  expressed protein  33.33 
 
 
737 aa  45.4  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31115  zinc finger transcription factor  34.38 
 
 
765 aa  45.4  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28000  Fungal-specific transcription factor  43.9 
 
 
858 aa  45.4  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.395949  normal  0.0721946 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80414  MADS box transcription factor  33.8 
 
 
783 aa  45.4  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.854363 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06396  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  44.19 
 
 
772 aa  45.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00359431  normal  0.0434138 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28271  Rac GTPase-activating protein BCR/ABR  32.5 
 
 
710 aa  45.1  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.692213  normal  0.257016 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03769  Putative Zn(II)2Cys6 transcription factor (Eurofung)  31.25 
 
 
532 aa  44.3  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.624876  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00110  conserved hypothetical protein  38.89 
 
 
728 aa  44.3  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.441864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>