13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_54643 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011679  PHATR_54643  predicted protein  100 
 
 
430 aa  897    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50055  predicted protein  86.05 
 
 
430 aa  800    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.578358  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49426  predicted protein  49.53 
 
 
449 aa  394  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49425  predicted protein  44.42 
 
 
504 aa  355  7.999999999999999e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55162  predicted protein  42.13 
 
 
437 aa  287  2.9999999999999996e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.662149  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47410  predicted protein  37.23 
 
 
484 aa  264  2e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3273  hypothetical protein  39.89 
 
 
478 aa  124  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0687558  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44141  predicted protein  30.81 
 
 
715 aa  87.4  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.609078  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1999  ankyrin repeat-containing protein  40.32 
 
 
512 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.224221 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  35.71 
 
 
4520 aa  43.9  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2472  hypothetical protein  38.98 
 
 
133 aa  43.5  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.291447 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0197  ankyrin repeat-containing protein  35.94 
 
 
165 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3768  ankyrin  36.11 
 
 
525 aa  43.5  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>