13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48703 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_48703  predicted protein  100 
 
 
344 aa  710    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.790939  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42613  predicted protein  24.9 
 
 
453 aa  64.3  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46871  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase small subunit N-methyltransferase I  23.21 
 
 
575 aa  63.5  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.139312  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48815  predicted protein  27.64 
 
 
519 aa  63.5  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40473  predicted protein  27.03 
 
 
488 aa  58.9  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30738  predicted protein  36 
 
 
390 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06568  SET domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G04520)  21.74 
 
 
484 aa  54.3  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.622081  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37749  predicted protein  30.71 
 
 
579 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89730  predicted protein  23.4 
 
 
484 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00881684 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15488  predicted protein  34.52 
 
 
490 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427459  decreased coverage  0.000333218 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27063  predicted protein  26.99 
 
 
813 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00530914  hitchhiker  0.0000354859 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42601  predicted protein  33.72 
 
 
531 aa  43.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28212  predicted protein  35.53 
 
 
495 aa  42.7  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.19293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>