15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46535 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_46535  predicted protein  100 
 
 
343 aa  697    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.076803  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49525  predicted protein  44.76 
 
 
512 aa  94  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0165471  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49526  predicted protein  45.22 
 
 
1633 aa  92.8  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49838  predicted protein  39.84 
 
 
557 aa  84.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44256  predicted protein  58.18 
 
 
541 aa  81.6  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45431  predicted protein  39.1 
 
 
1158 aa  81.3  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.693925  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_5960  predicted protein  39.58 
 
 
275 aa  69.3  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_6612  predicted protein  45.1 
 
 
239 aa  56.2  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.950198  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44331  predicted protein  41.07 
 
 
253 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8087  predicted protein  44.59 
 
 
158 aa  53.5  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0755721  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_9264  predicted protein  46.67 
 
 
64 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0312665 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9418  predicted protein  40.68 
 
 
77 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.04591  normal  0.979656 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47205  predicted protein  32.84 
 
 
555 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.551537  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48038  predicted protein  24.05 
 
 
1717 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.322069  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49808  predicted protein  24.05 
 
 
1718 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.365245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>