15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_38974 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_38974  predicted protein  100 
 
 		 488 aa  1014    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.103286  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32467  predicted protein  31.82 
 
 		 609 aa  82  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.215705  normal  0.136485 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48815  predicted protein  26.96 
 
 		 519 aa  73.9  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04000  cytoplasm protein, putative  28.8 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05630  SET domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G11040)  22.6 
 
 		 707 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.246527 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40473  predicted protein  34.04 
 
 		 488 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18374  predicted protein  27.72 
 
 		 375 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.892854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27063  predicted protein  26.59 
 
 		 813 aa  50.4  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00530914  hitchhiker  0.0000354859 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16391  predicted protein  22.97 
 
 		 457 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00690  SET domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13520)  24.17 
 
 		 480 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57570  predicted protein  34.25 
 
 		 611 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0322438  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42601  predicted protein  23.46 
 
 		 531 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46871  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase small subunit N-methyltransferase I  23.89 
 
 		 575 aa  44.3  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.139312  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16466  predicted protein  31.25 
 
 		 465 aa  43.5  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15488  predicted protein  27.97 
 
 		 490 aa  43.5  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.427459  decreased coverage  0.000333218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>