15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_32441 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_32441  predicted protein  100 
 
 
380 aa  789    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_93639  predicted protein  28.49 
 
 
281 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.252566 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29666  predicted protein  28.49 
 
 
281 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.294797  normal  0.0130447 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44043  predicted protein  25.44 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.198797  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47578  predicted protein  27.41 
 
 
333 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.226314  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28521  predicted protein  27.96 
 
 
229 aa  51.2  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17089  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46930  predicted protein  55.56 
 
 
352 aa  49.7  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.769754  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10134  glucose-inducible SAM-dependent methyltransferase Rrg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16310)  33.87 
 
 
354 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0273649  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45331  predicted protein  26.55 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0689578  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  31.03 
 
 
215 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45902  predicted protein  25.13 
 
 
410 aa  44.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.361272 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16663  predicted protein  24.59 
 
 
1048 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.207195 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10539  hypothetical protein  23.53 
 
 
247 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.041688  hitchhiker  0.000199182 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30928  predicted protein  28.67 
 
 
169 aa  43.1  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07290  conserved hypothetical protein  33.68 
 
 
250 aa  42.7  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>