18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1556 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1556  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  220  6e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1081  hypothetical protein  51.4 
 
 		 115 aa  106  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00650626  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2259  hypothetical protein  44.35 
 
 		 119 aa  102  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000118561  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1158  hypothetical protein  46.15 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0041  hypothetical protein  55.86 
 
 		 113 aa  98.6  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00636964  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0800  hypothetical protein  46.08 
 
 		 155 aa  87.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2683  hypothetical protein  40.37 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.828322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0775  hypothetical protein  39.45 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3672  hypothetical protein  40.37 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1233  hypothetical protein  39.42 
 
 		 112 aa  76.6  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.921092  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2339  hypothetical protein  37.5 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3361  hypothetical protein  37.62 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00221996  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39620  hypothetical protein  37.62 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.8273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2654  hypothetical protein  37.62 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0724  hypothetical protein  30.1 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27460  hypothetical protein  30.39 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0416208  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1201  hypothetical protein  29.29 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.240997  normal  0.738905 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1478  hypothetical protein  28.28 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>