20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0411 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0422  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  290  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0819991  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0411  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
141 aa  290  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1288  TPR repeat-containing protein  69.57 
 
 
141 aa  206  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.806395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2909  TPR repeat-containing protein  58.09 
 
 
139 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298269  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0204  TPR repeat-containing protein  58.7 
 
 
140 aa  178  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4782  TPR repeat-containing protein  55.8 
 
 
140 aa  176  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0910  hypothetical protein  54.68 
 
 
142 aa  176  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.328003 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01911  hypothetical protein  48.18 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.775534 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2358  hypothetical protein  46.27 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1486  hypothetical protein  48.91 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.952228  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0333  hypothetical protein  45.26 
 
 
139 aa  140  5e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26241  hypothetical protein  45.26 
 
 
139 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.49947 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01331  hypothetical protein  43.07 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0474344  normal  0.486944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3950  TPR repeat-containing protein  50.72 
 
 
140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.174143  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01351  hypothetical protein  40.6 
 
 
142 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01341  hypothetical protein  40.6 
 
 
142 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.442457  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0120  hypothetical protein  38.35 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01311  hypothetical protein  36.09 
 
 
142 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2821  hypothetical protein  30.95 
 
 
676 aa  41.2  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.114598 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 
247 aa  41.2  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>