23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5385 on replicon NC_011737
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5385  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  256  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5301  hypothetical protein  47.5 
 
 
126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1762  hypothetical protein  40.34 
 
 
122 aa  96.7  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000014104  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003192  cytochrome P-450:NADPH-P-450 reductase  36 
 
 
124 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1360  hypothetical protein  38.14 
 
 
125 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6643  hypothetical protein  34.96 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174293  normal  0.0338703 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6227  hypothetical protein  37.4 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0274044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1604  hypothetical protein  37.4 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6703  hypothetical protein  37.4 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.640276 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2891  hypothetical protein  33.82 
 
 
162 aa  76.6  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674901 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5729  hypothetical protein  36.13 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0528  hypothetical protein  34.65 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1428  hypothetical protein  32.43 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0545971  normal  0.100663 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5974  hypothetical protein  33.61 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0237314  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3211  hypothetical protein  31.4 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.750563  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0198  hypothetical protein  27.27 
 
 
125 aa  58.2  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.241475 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2386  hypothetical protein  31.2 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.417622  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1879  putative secreted protein  22.88 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562565  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1798  hypothetical protein  25.89 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394364  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3057  hypothetical protein  28.45 
 
 
215 aa  41.2  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00975792 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0043  hypothetical protein  28.85 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.456021  normal  0.419625 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0947  hypothetical protein  21.55 
 
 
195 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1295  hypothetical protein  23.48 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.211748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>