32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3384 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3384  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  100 
 
 		 404 aa  833    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0842787 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0613  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  72.52 
 
 		 407 aa  623  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0598  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  72.52 
 
 		 407 aa  623  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1743  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  65.4 
 
 		 409 aa  546  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.505987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0861  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  61.01 
 
 		 429 aa  498  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0589823  normal  0.0593314 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4290  fatty acid hydroxylase  51.27 
 
 		 412 aa  389  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.762452  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3742  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  51.92 
 
 		 420 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.843241  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1713  short chain dehydrogenase  44.13 
 
 		 249 aa  209  7e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04781  short chain dehydrogenase  45.53 
 
 		 257 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.864402 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06851  short chain dehydrogenase  44.54 
 
 		 256 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0646  short chain dehydrogenase  46.24 
 
 		 245 aa  178  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05411  short chain dehydrogenase  43.91 
 
 		 238 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0882215  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0478  short chain dehydrogenase  44.83 
 
 		 239 aa  176  8e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05331  short chain dehydrogenase  41.35 
 
 		 239 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.647746  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05341  short chain dehydrogenase  42.62 
 
 		 254 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.118311 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05031  short chain dehydrogenase  40.95 
 
 		 239 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1810  short chain dehydrogenase  41.1 
 
 		 254 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0109813  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_12277  hypothetical protein  26.7 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  33.61 
 
 		 244 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3406  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.83 
 
 		 249 aa  45.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1389  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.05 
 
 		 466 aa  44.7  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.010346  hitchhiker  0.0000000115486 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1069  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.88 
 
 		 466 aa  44.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00194545  normal  0.569191 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1642  short chain dehydrogenase  26.42 
 
 		 705 aa  44.7  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1309  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 		 466 aa  44.3  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00018811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  32.76 
 
 		 276 aa  43.9  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  26.98 
 
 		 256 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22780  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  29.27 
 
 		 251 aa  43.5  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.503497 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1803  short chain dehydrogenase  31.19 
 
 		 705 aa  43.5  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.71 
 
 		 349 aa  43.1  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1769  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.95 
 
 		 245 aa  43.1  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.485655 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00023  short chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16570)  22.18 
 
 		 313 aa  43.1  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.63949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.18 
 
 		 280 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152344 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>