19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2436 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3912  DEAD-like helicase  98.8 
 
 		 520 aa  1017    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2436  DEAD-like helicase  100 
 
 		 834 aa  1728    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1147  DEAD-like helicases-like  26.78 
 
 		 859 aa  229  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1592  helicase c2  25.91 
 
 		 861 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0332  dead/deah box helicase domain-containing protein  23.91 
 
 		 845 aa  202  1.9999999999999998e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.616588  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1305  DEAD-like helicase  25.03 
 
 		 829 aa  199  3e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0305495  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1967  hypothetical protein  23.05 
 
 		 847 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00196238  normal  0.91611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6719  helicase c2  26.87 
 
 		 840 aa  173  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1993  helicase c2  25.42 
 
 		 701 aa  151  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.214051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4050  DEAD-like helicase  23.67 
 
 		 857 aa  125  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429268  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.95 
 
 		 714 aa  50.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4290  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.64 
 
 		 714 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1161  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.17 
 
 		 714 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665209  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1125  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.17 
 
 		 714 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437588  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1146  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.7 
 
 		 714 aa  45.4  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.980909  normal  0.730569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.35 
 
 		 714 aa  45.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3036  helicase c2  29.17 
 
 		 927 aa  44.7  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.508804  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1456  helicase c2  31.4 
 
 		 962 aa  44.3  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.107877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4120  ATP-dependent helicase, DinG family  23.35 
 
 		 714 aa  44.3  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>