15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2281 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2281  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  862    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.126293 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2280  hypothetical protein  43.67 
 
 
462 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.164238 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2405  hypothetical protein  31.49 
 
 
376 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2987  hypothetical protein  30.77 
 
 
395 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328187  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2201  hypothetical protein  32.23 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.653619  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3573  hypothetical protein  28.37 
 
 
367 aa  86.7  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0820856  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0026  hypothetical protein  27.23 
 
 
359 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.645482  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1428  hypothetical protein  26.32 
 
 
386 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119781 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4474  hypothetical protein  24.75 
 
 
418 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1418  hypothetical protein  26.69 
 
 
370 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.663029  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  34.75 
 
 
373 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2283  protein of unknown function DUF1555  63.64 
 
 
330 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4285  hypothetical protein  30 
 
 
361 aa  47.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.380476  normal  0.155878 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2754  hypothetical protein  23.03 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.289824  normal  0.0182175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0137  hypothetical protein  25.09 
 
 
373 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407835  normal  0.921915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>